Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms