Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms