Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMTC2Q8N394 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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