Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms