Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWDEQ8N2E2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms