Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC83Q8IWF9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms