Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms