Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX29P2Q8IUI4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms