Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERMT3Q86UX7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FERMT3Q86UX7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms