Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP54Q7Z3B4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms