Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms