Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC80Q76M96 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms