Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q71RC1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q71RC1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q71RC1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q71RC1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q71RC1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q71RC1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q71RC1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q71RC1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q71RC1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q71RC1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q71RC1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms