Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms