Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC73Q6ZRK6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms