Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms