Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEACAM20Q6UY09 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms