Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms