Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRSAM1Q6UWE0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms