Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC62Q6P9F0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms