Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54Q6NXT1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms