Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPH2Q6IBW4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms