Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTP1Q6DN14 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms