Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102BQ68D86 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102BQ68D86 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102BQ68D86 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms