Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms