Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USPL1Q5W0Q7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms