Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms