Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms