Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms