Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA8Q53HL2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA8Q53HL2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms