Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms