Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf46Q504U0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms