Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms