Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY2Q49AN0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms