Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms