Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms