Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KNOP1Q1ED39 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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