Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPROQ16827 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTPROQ16827 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTPROQ16827 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTPROQ16827 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTPROQ16827 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTPROQ16827 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PTPROQ16827 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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