Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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TNXAQ16473 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXAQ16473 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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