Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITSN1Q15811 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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