Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHBQ15464 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHBQ15464 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHBQ15464 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHBQ15464 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHBQ15464 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHBQ15464 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHBQ15464 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms