Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms