Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUM3Q15397 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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