Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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