Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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