Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3GAP1Q15042 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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