Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CBX2Q14781 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBX2Q14781 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms