Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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