Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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