Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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